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MS2PH
: des mutations humaines aux phénotypes des maladies). c'est un outil d'analyse descriptive
et fonctionnelle des protéines pour faciliter la compréhension des conséquences des mutations
pour les maladies humaines.Ce projet s'inscrit dans le contexte fondamental de la compréhension des mécanismes qui contrôlent
la fonction des protéines. En effet, la façon dont une protéine se replie dans l'espace détermine ses interactions avec
l'environnement cellulaire, y compris la manière dont elle va interagir avec les molécules thérapeutiques.
Ce projet a été le tout premier projet porté sur la grille universitaire. 1036 protéines impliquées dans des pathologies génétiques humaines
sont utilisées pour remettre à jour une base de données qui est utilisé par dans un serveur web : MAGOS. MAGOS permet, de réaliser une recherche exhaustive
des séquences/structures homologues à une protéine cible impliquée dans une pathologie humaine.
l'application qui est utilisée sur les super-calculateurs de la grille Décrypthon a été développé par
l'équipe
LGBI
d'
Olivier Poch
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Elle s'appelle
PipeAlign
, C'est un ensemble de briques applicatives permettant d'obtenir
un alignement multiple à partir d'une protéine et d'une banque de donnée ( PDB, SWISSPROT, PROTALL ...)
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