Page Menu

Latest news

October 6, 2010
HDR Defense at ENS Lyon.

Links:

• Avalon
• CNRS
• DIET
• ENS-Lyon
• Graal
• Grid'5000
• INRIA RA
• LIP
• Seed4C
• SPADES
• SysFera
• Webgen

Cluster GDS / DMI

Le cluster de gdsdmi est un cluster composé de 27 noeuds en deux parties virtuelles. Une partie recherche et une partie enseignement. Les noeuds GDS sont donc prioritairement utilisés par les membres de l’ACI GDS (voir le site web pour plus d’info). Les noeuds DMI sont quant à eux prioritairement destinés au DMI. Dans les deux cas une utilisation complète de l’ensemble du cluster par les deux parties est possible.

Comment accéder à ce cluster

Demander l'ouverture d'un compte

Envoyer un mail à Eddy Caron en précisant :

• si votre demande concerne l’ACI GDS ou le DMI.
• afin de vous communiquer votre ou vos (dans le cas de demandes multiples), un numéro de téléphone ou je peux vous joindre au besoin (s’il s’agit d’une inscription d’un enseignant pour un groupe d’élèves seul le numéro de téléphone de l’enseignant est nécessaire.)

Organisation

La grappe est composé de 4 types différents de ressources reliés à un switch. Dans le but de permettre des réservations faciles pour des exécutions parallètes (typiquement utilisant MPI), 4 files d’attentes ont été mises en place. Ainsi, l’organisation de la grappe est ainsi constituée :

• Frontale : gdsdmi01
• queue28 : les noeuds gdsdmi02 à gdsdmi08
• queue913 : les noeuds gdsdmi09 à gdsdmi13
• queue1420 : les noeuds gdsdmi14 à gdsdmi20
• queue2127 : les noeuds gdsdmi21 à gdsdmi27
• queue227 : l’ensemble des noeuds
• Enseignement : pour que les enseignants puissent réserver les ressources en priorité pour les cours
• admin : priorité encore supérieure pour les travaux d’administration

Comment soumettre

• Vérifiez que vous appartenez au groupe oar (il suffit de taper groups pour connaître les groupes auxquels vous appartenez). Il faut tout d’abord régler votre environnement pour avoir accés aux commandes OAR et à leur manpage. Pour cela, assurez-vous que votre fichier ~/.bashprofile comporte les 2 lignes :
  export PATH=/usr/local/oarinst/install/bin:/usr/local/oarinst/install/oar:$PATH
  export MANPATH=/usr/local/oarinst/install/man:$MANPATH
  

• Voici 3 exemples pour soumettre sur gdsdmi. Vous trouverez la syntaxe compète dans les manpages qui sont accessibles sur les noeuds gdsdmi, et ici .

  • Soumission d’une tâche sur 4 noeuds homogènes de queue913 : oarsub -q queue913 -l nodes=4 nomScript

  • Soumission d’une tâche sur 2 noeuds éventuellement hétérogène : oarsub -l nodes=2 -q queue227 Remarque : la queue par défaut est queue227, donc on peut ne pas préciser de queue

  • Soumission d’une tâche sur 3 noeuds hétérogènes ciblés : oarsub -l nodes=3 -p “hostname = ‘gdsdmi04’ OR hostname = ‘gdsdmi16’ OR host = ‘gdsdmi23’” nomScript
    

    Exemple d'un script de soumission OAR

Utilisation de GDSDMI

2 outils sont à disposition mais ne sont accessible que depuis un accès interne (ou via le VPN de l’école). Le premier, Monika, permet de savoir les ressources qui sont occupées, jusqu’à quand, et les requêtes en cours. Le second, DrawOARGantt, permet de visualiser de faĉon interactives les diagrammes de Gantt des tâches de calcul qui ont été soumises.

Les autres commandes

• Récupérer les informations sur une tâhe soumise : oarstat [-j IDjob]
• Tuer une soumission : oardel